Tháng 3 năm 2021: Sau một chấn thương ở đầu, Kosane Kiriha, 24 tuổi, phát hiện ra mình không có não. Ngay sau đó, Kyubey xuất hiện trước mặt cô lần đầu tiên sau mười năm. Nó tiết lộ rằng thay vì có não, Kosane có một khối u tế bào Incubator đang điều khiển cơ thể cô. Và tệ hơn nữa, thời - không đang liên tục sụp đổ xung quanh cô ấy.

Với sự giúp đỡ của Kyubey, Kosane tìm được 1 lá thư từ người em sinh đôi Eruna trong hộp sọ của cô ấy. Bên trong nó có 1 chiếc thẻ thông hành cho chuyến tàu thời gian.

Cuối cùng sau khi lên tàu, Kosane đã ngất xỉu sau khi bị tấn công bởi các Ma pháp thiếu nữ bí ẩn đã ở trên tàu.

Các nhân vật bao gồm:

Kosane Kiriha: Một sinh viên mới tốt nghiệp 24 tuổi. Mười năm trước, cô đã cố gắng ký khế ước với Kyubey. Tuy nhiên, vì không có linh hồn, cô không thể trở thành Ma pháp thiếu nữ. Tiêu đề luận văn của cô là ''Nghiên cứu về cái gọi là cuộc cách mạng nhận thức''. Thất bại trong việc tìm kiếm việc làm, cô ấy sẽ thất nghiệp một cách vô vọng vào tháng tư.

Kyubey: Một sinh vật mèo-thỏ kì lạ hỗ trợ Kosane khi nó cưỡi cô đi xung quanh trong hộp sọ rỗng của cô.

Eruna Kiriha: Người em song sinh giống hệt Kosane đã chết khi mới sinh ra và vẫn còn là người bạn tưởng tượng thời thơ ấu của Kosane.